Mevcut İncillere inanacak olursak Yudas, Hz. İsa'yı ele vererek ona ihanet etti. Ama ya Yudas da kendi İncil'ini yazıp tanık olduğu hadiseleri kendi ağzından anlatsaydı? Yudas İncili, Ölü Deniz’de bulunan bir el yazmasının peşinden giderek, Hz. İsa’nın hayatına dair bilinmeyen yönleri sorguluyor. Aynı zamanda biri İkinci Dünya Savaşı sırasında ve diğeri de günümüz Roma’sında geçen birbirleriyle ilintili iki farklı olayın açtığı dehlizler eşliğinde… Romanın kahramanları, Yudas ile Peder Leo Newman. Peder Leo, Yudas İncili’nin peşinden giderken kendi hayatının da peşinden gidiyor. Kendi geçmişinin, yaşadığı yasak aşkın ve kendi ihanetlerinin… Yudas İncili, Roma’dan Kudüs’e uzanan bir maceranın, entrikanın, aşkın, ihanetin ve yalanların romanı…